Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQI0

ATAT1, Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAT1Q5SQI0 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAT1Q5SQI0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATAT1Q5SQI0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATAT1Q5SQI0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATAT1Q5SQI0 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAT1Q5SQI0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAT1Q5SQI0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAT1Q5SQI0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAT1Q5SQI0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAT1Q5SQI0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAT1Q5SQI0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms