Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP78Q5JTW2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms