Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC9

AKAP4, A-kinase anchor protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP4Q5JQC9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AKAP4Q5JQC9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AKAP4Q5JQC9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AKAP4Q5JQC9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AKAP4Q5JQC9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AKAP4Q5JQC9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AKAP4Q5JQC9 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AKAP4Q5JQC9 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AKAP4Q5JQC9 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AKAP4Q5JQC9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AKAP4Q5JQC9 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AKAP4Q5JQC9 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AKAP4Q5JQC9 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AKAP4Q5JQC9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AKAP4Q5JQC9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AKAP4Q5JQC9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AKAP4Q5JQC9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AKAP4Q5JQC9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AKAP4Q5JQC9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AKAP4Q5JQC9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AKAP4Q5JQC9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AKAP4Q5JQC9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AKAP4Q5JQC9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AKAP4Q5JQC9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AKAP4Q5JQC9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AKAP4Q5JQC9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AKAP4Q5JQC9 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AKAP4Q5JQC9 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AKAP4Q5JQC9 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AKAP4Q5JQC9 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AKAP4Q5JQC9 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AKAP4Q5JQC9 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AKAP4Q5JQC9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AKAP4Q5JQC9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AKAP4Q5JQC9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AKAP4Q5JQC9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AKAP4Q5JQC9 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AKAP4Q5JQC9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AKAP4Q5JQC9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AKAP4Q5JQC9 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms