Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC93Q567U6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC93Q567U6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms