Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms