Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LACTB2Q53H82 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LACTB2Q53H82 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms