Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GREB1Q4ZG55 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms