Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms