Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LONRF3Q496Y0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LONRF3Q496Y0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LONRF3Q496Y0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
LONRF3Q496Y0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LONRF3Q496Y0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LONRF3Q496Y0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LONRF3Q496Y0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LONRF3Q496Y0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LONRF3Q496Y0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LONRF3Q496Y0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LONRF3Q496Y0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LONRF3Q496Y0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LONRF3Q496Y0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LONRF3Q496Y0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LONRF3Q496Y0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LONRF3Q496Y0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LONRF3Q496Y0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LONRF3Q496Y0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LONRF3Q496Y0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LONRF3Q496Y0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LONRF3Q496Y0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LONRF3Q496Y0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LONRF3Q496Y0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LONRF3Q496Y0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LONRF3Q496Y0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms