Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBPF8Q3BBV2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms