Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC27Q2M243 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms