Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Q1T7F1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Q1T7F1 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms