Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PDK4Q16654 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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