Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SNCBQ16143 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNCBQ16143 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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