Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NECTIN1Q15223 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms