Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDGFRLQ15198 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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