Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDK3Q15120 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDK3Q15120 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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