Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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