Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAM2Q15035 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAM2Q15035 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
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