Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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NCAPHQ15003 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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