Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMCO1Q147U7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms