Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
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RFTN1Q14699 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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RFTN1Q14699 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RFTN1Q14699 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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