Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPIDRQ14159 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIDRQ14159 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms