Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
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CBFBQ13951 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBFBQ13951 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBFBQ13951 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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