Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRQ13535 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRQ13535 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRQ13535 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRQ13535 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRQ13535 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRQ13535 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRQ13535 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRQ13535 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
ATRQ13535 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
ATRQ13535 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ATRQ13535 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ATRQ13535 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
ATRQ13535 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
ATRQ13535 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ATRQ13535 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
ATRQ13535 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ATRQ13535 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ATRQ13535 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ATRQ13535 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ATRQ13535 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ATRQ13535 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ATRQ13535 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ATRQ13535 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ATRQ13535 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ATRQ13535 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ATRQ13535 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ATRQ13535 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ATRQ13535 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRQ13535 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRQ13535 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRQ13535 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRQ13535 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRQ13535 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRQ13535 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRQ13535 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRQ13535 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRQ13535 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRQ13535 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRQ13535 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRQ13535 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRQ13535 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRQ13535 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRQ13535 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRQ13535 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRQ13535 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRQ13535 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRQ13535 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRQ13535 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRQ13535 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRQ13535 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRQ13535 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRQ13535 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRQ13535 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRQ13535 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRQ13535 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRQ13535 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRQ13535 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRQ13535 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRQ13535 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRQ13535 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATRQ13535 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRQ13535 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRQ13535 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRQ13535 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRQ13535 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRQ13535 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRQ13535 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRQ13535 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRQ13535 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRQ13535 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRQ13535 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRQ13535 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRQ13535 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRQ13535 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRQ13535 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRQ13535 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRQ13535 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRQ13535 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRQ13535 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRQ13535 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRQ13535 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRQ13535 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRQ13535 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRQ13535 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRQ13535 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRQ13535 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRQ13535 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRQ13535 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRQ13535 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRQ13535 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRQ13535 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRQ13535 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRQ13535 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRQ13535 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRQ13535 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRQ13535 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRQ13535 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRQ13535 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATRQ13535 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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