Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PICALMQ13492 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PICALMQ13492 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms