Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCIRG1Q13488 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCIRG1Q13488 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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