Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF6Q13247 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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