Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CALCOCO2Q13137 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALCOCO2Q13137 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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