Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NR1H3Q13133 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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NR1H3Q13133 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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NR1H3Q13133 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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NR1H3Q13133 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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NR1H3Q13133 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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NR1H3Q13133 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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NR1H3Q13133 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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NR1H3Q13133 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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NR1H3Q13133 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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NR1H3Q13133 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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NR1H3Q13133 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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