Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HSPB3Q12988 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HSPB3Q12988 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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