Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COX10Q12887 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COX10Q12887 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COX10Q12887 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COX10Q12887 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
COX10Q12887 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COX10Q12887 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
COX10Q12887 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COX10Q12887 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COX10Q12887 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COX10Q12887 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COX10Q12887 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COX10Q12887 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
COX10Q12887 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COX10Q12887 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COX10Q12887 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COX10Q12887 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COX10Q12887 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COX10Q12887 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COX10Q12887 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COX10Q12887 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
COX10Q12887 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
COX10Q12887 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COX10Q12887 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COX10Q12887 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COX10Q12887 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COX10Q12887 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COX10Q12887 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COX10Q12887 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COX10Q12887 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COX10Q12887 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COX10Q12887 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COX10Q12887 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COX10Q12887 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COX10Q12887 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COX10Q12887 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COX10Q12887 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
COX10Q12887 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COX10Q12887 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COX10Q12887 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COX10Q12887 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COX10Q12887 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COX10Q12887 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COX10Q12887 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COX10Q12887 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COX10Q12887 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COX10Q12887 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COX10Q12887 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COX10Q12887 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COX10Q12887 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COX10Q12887 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COX10Q12887 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COX10Q12887 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COX10Q12887 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
COX10Q12887 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COX10Q12887 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COX10Q12887 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COX10Q12887 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COX10Q12887 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COX10Q12887 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COX10Q12887 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COX10Q12887 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COX10Q12887 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX10Q12887 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX10Q12887 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX10Q12887 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX10Q12887 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
COX10Q12887 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX10Q12887 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX10Q12887 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX10Q12887 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX10Q12887 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX10Q12887 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX10Q12887 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX10Q12887 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX10Q12887 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX10Q12887 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX10Q12887 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX10Q12887 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX10Q12887 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX10Q12887 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX10Q12887 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
COX10Q12887 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
COX10Q12887 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX10Q12887 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX10Q12887 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX10Q12887 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX10Q12887 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX10Q12887 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX10Q12887 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX10Q12887 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX10Q12887 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX10Q12887 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX10Q12887 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX10Q12887 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX10Q12887 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX10Q12887 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX10Q12887 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX10Q12887 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COX10Q12887 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms