Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GRIN2AQ12879 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
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