Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BPTFQ12830 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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