Protein–RNA interactions for Protein: Q10472

GALNT1, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT1Q10472 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms