Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFFO1Q0D2I5 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms