Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE4CQ08493 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE4CQ08493 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms