Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD51Q06609 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms