Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms