Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNC4Q03721 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms