Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUD4Q01804 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms