Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MC1RQ01726 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MC1RQ01726 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms