Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms