Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITPNAQ00169 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms