Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA1P68133 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms