Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms