Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTBP60709 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTBP60709 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTBP60709 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTBP60709 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTBP60709 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTBP60709 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTBP60709 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTBP60709 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTBP60709 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTBP60709 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTBP60709 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTBP60709 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTBP60709 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTBP60709 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTBP60709 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTBP60709 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTBP60709 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTBP60709 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTBP60709 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTBP60709 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTBP60709 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTBP60709 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTBP60709 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTBP60709 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTBP60709 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTBP60709 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTBP60709 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTBP60709 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTBP60709 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTBP60709 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTBP60709 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTBP60709 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTBP60709 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTBP60709 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTBP60709 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTBP60709 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTBP60709 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTBP60709 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTBP60709 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTBP60709 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTBP60709 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTBP60709 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTBP60709 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACTBP60709 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACTBP60709 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACTBP60709 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACTBP60709 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACTBP60709 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACTBP60709 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACTBP60709 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACTBP60709 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACTBP60709 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACTBP60709 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTBP60709 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTBP60709 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTBP60709 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTBP60709 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTBP60709 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTBP60709 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTBP60709 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTBP60709 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTBP60709 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTBP60709 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTBP60709 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTBP60709 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTBP60709 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTBP60709 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTBP60709 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTBP60709 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTBP60709 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTBP60709 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTBP60709 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTBP60709 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTBP60709 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTBP60709 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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