Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA3P59666 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA3P59666 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms