Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LOXL3P58215 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LOXL3P58215 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LOXL3P58215 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LOXL3P58215 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LOXL3P58215 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms