Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP107P57740 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP107P57740 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP107P57740 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP107P57740 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP107P57740 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP107P57740 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP107P57740 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP107P57740 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP107P57740 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP107P57740 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP107P57740 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP107P57740 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP107P57740 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP107P57740 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP107P57740 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP107P57740 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP107P57740 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP107P57740 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP107P57740 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP107P57740 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP107P57740 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP107P57740 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP107P57740 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP107P57740 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP107P57740 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP107P57740 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP107P57740 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP107P57740 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP107P57740 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP107P57740 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP107P57740 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP107P57740 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP107P57740 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP107P57740 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP107P57740 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP107P57740 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP107P57740 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP107P57740 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP107P57740 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP107P57740 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP107P57740 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP107P57740 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP107P57740 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP107P57740 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP107P57740 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP107P57740 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP107P57740 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP107P57740 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP107P57740 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP107P57740 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP107P57740 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP107P57740 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP107P57740 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP107P57740 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP107P57740 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP107P57740 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP107P57740 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP107P57740 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP107P57740 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP107P57740 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP107P57740 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP107P57740 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP107P57740 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP107P57740 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP107P57740 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP107P57740 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP107P57740 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP107P57740 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP107P57740 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP107P57740 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP107P57740 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP107P57740 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP107P57740 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP107P57740 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP107P57740 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP107P57740 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP107P57740 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP107P57740 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP107P57740 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP107P57740 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP107P57740 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP107P57740 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP107P57740 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP107P57740 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP107P57740 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP107P57740 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP107P57740 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP107P57740 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP107P57740 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP107P57740 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP107P57740 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP107P57740 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP107P57740 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP107P57740 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP107P57740 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP107P57740 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP107P57740 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP107P57740 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP107P57740 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms